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PCR反应RNA质量检测过程

日期:2024-08-28 10:29
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摘要: RNA质量检测过程: 1. 紫外吸收法测定 先用稀释用的TE溶液将分光光度计调零。然后取少量RNA溶液用TE稀释(1:100)后,读取其在分光光度计260nm和280nm处的吸收值,测定RNA溶液 浓度和纯度。 (1)浓度测定 A260下读值为1表示40 ug RNA/ml。样品RNA浓度(μg/ml)计算公式为:A260 x 稀释倍数 x 40 ug/ml。具体计算如下: RNA溶于40 ul DEPC水中,取5 ul,1:100稀释至495 ul的TE中,测得A260 = 0.21 RNA 浓度= 0.21 x ...

RNA质量检测过程:


1.  紫外吸收法测定


先用稀释用的TE溶液将分光光度计调零。然后取少量RNA溶液用TE稀释(1:100)后,读取其在分光光度计260nm和280nm处的吸收值,测定RNA溶液 浓度和纯度。


(1)浓度测定


A260下读值为1表示40 ug RNA/ml。样品RNA浓度(μg/ml)计算公式为:A260 x 稀释倍数 x 40 ug/ml。具体计算如下:


RNA溶于40 ul DEPC水中,取5 ul,1:100稀释至495 ul的TE中,测得A260 = 0.21


RNA 浓度= 0.21 x 100 x 40 ug/ml = 840 ug/ml 或 0.84 ug/ul


取5 ul用来测量以后,剩余样品RNA为35 ul,剩余RNA总量为:


35 ul x 0.84 ug/ul = 29.4 ug


(2)纯度检测


RNA溶液的A260/A280的比值即为RNA纯度,比值范围1.8到2.1。


2.  变性琼脂糖凝胶电泳测定


(1)制胶


1 g琼脂糖溶于72 ml水中,冷却至60℃,10 ml的10 x MOPS电泳缓冲液和18 ml的37% 甲醛溶液(12.3 M)。


10x MOPS电泳缓冲液

浓度  成分

0.4 M  MOPS,pH 7.0

0.1 M  乙酸钠

0.01 M  EDTA


灌制凝胶板,预留加样孔至少可以加入25 μl溶液。胶凝后取下梳子,将凝胶板放入电泳槽内,加足量的1xMOPS电泳缓冲液至覆盖胶面几个毫米。


(2)准备RNA样品


取3 ugRNA,加3倍体积的甲醛上样染液,加EB于甲醛上样染液中至终浓度为10 ug/ml。加热至70℃孵育15分钟使样品变性。


(3)电泳


上样前凝胶须预电泳5 min,随后将样品加入上样孔。5-6 V/cm电压下2 h,电泳至溴酚兰指示剂进胶至少2-3 cm。


(4)紫外透射光下观察并拍照


28S和18S核糖体RNA的带非常亮而浓(其大小决定于用于抽提RNA的物种类型),上面一条带的密度大约是下面一条带的2倍?;褂锌赡芄鄄斓揭桓龈∩晕⒗┥⒌拇?,它由低分子量的RNA(tRNA和5S核糖体RNA)组成。在18S和28S核糖体带之间可以看到一片弥散的EB染色物质,可能是由mRNA和其它异型RNA组成。RNA制备过程中如果出现DNA污染,将会在28S核糖体RNA带的上面出现,即更高分子量的弥散迁移物质或者带,RNA的降解表现为核糖体RNA带的弥散。用数码照相机拍下电泳结果。